叶坚
博士，特聘教授，博士生导师
地址: MED-X研究院213室，上海交通大学徐汇校区
邮件：yejian78@sjtu.edu.cn
教育背景
2005-2010，鲁汶大学， 化学， 博士
2000-2003，浙江大学， 高分子系，硕士
1997-2000，浙江大学， 高分子系，学士
工作经历
2026.5~至今，上海交通大学Med-X重大疾病物理治疗和检测设备工程技术研究中心， 主任
2018.1~至今，上海交通大学生物医学工程学院， 教授
2013.7~ 2017.12，上海交通大学生物医学工程学院， 特别研究员
2011.3-2011.8，Rice（莱斯）大学，访问学者
2010-2013，比利时微电子研究中心/比利时研究基金会，高级研究员
2003-2005，英特尔产品（上海）有限公司，材料工程师
研究方向
拉曼光谱和等离激元纳米材料的生物医学应用及其临床转化；
“数字胶体增强拉曼光谱”和“表面增强拉曼分子组学”的单细胞、单颗粒、单分子超灵敏检测；
高灵敏、无标记、快速液体活检的疾病诊断和代谢组学检测。
科研项目
国家重点研发计划，***增强拉曼光谱检测系统（2024-2026，主持）
国家自然科学基金面上项目,基于增强拉曼探针的***的大动物模型前哨淋巴结示踪研究（2023-2026，主持）
国家自然科学基金面上项目，基于“***”第二代缝隙增强拉曼探针的转移前哨淋巴结显影和鉴别（2019-2022, 主持）
国家自然科学基金优秀青年基金项目，表面等离激元纳米材料的生物医学应用（2017-2019，主持）
国家自然科学基金面上项目，基于“***”纳米颗粒表面增强拉曼光谱的高灵敏度和高重复性的多指标侧流层析免疫检测法（2016-2019，主持）
国家自然科学基金面上项目，基于“***”和“***”表面增强拉曼光谱的高灵敏度和高重复性的无标记检测技术（2014-2017，主持）
代表性论文
Xinyuan Bi, Daniel M. Czajkowsky, Zhifeng Shao, and Jian Ye*. Digital colloid-enhanced Raman spectroscopy by single-molecule counting, Nature, 2024, 628, 771-775.
Xinyuan Bi, Xiaohang Qian, Bingsen Xue, Miao Zhang, Shuyu Liu, Haoran Chen, Cheng Jin*, Huidong Tang*, Jian Ye*. Molecule-resolvable SERSome for metabolic profiling, Chem, 2025, 11, 102528.
Bingsen Xue, Xinyuan Bi, Zheyi Dong, Yunzhe Xu, Minghui Liang, Xin Fang, Yizhe Yuan, Ruoxi Wang, Shuyu Liu, Rushi Jiao, Yuze Chen, Weitao Zu, Chengxiang Wang, Jianhao Zhang, Jiang Liu, Qin Zhang, Ye Yuan, Midie Xu, Ya Zhang, Yanfeng Wang, Jian Ye*, Cheng Jin*. Deep spectral component filtering as a foundation model for spectral analysis demonstrated in metabolic profiling, Nature Machine Intelligence, 2025, 7, 743–757.
Xinyuan Bi, Jiayi Wang, Bingsen Xue, Chang He, Fugang Liu, Haoran Chen, Linley Li Lin, Baijun Dong, Butang Li, Cheng Jin*, Jiahua Pan*, Wei Xue*, and Jian Ye*. SERSomes for Metabolic Phenotyping and Prostate Cancer Diagnosis, Cell Reports Medicine, 2024, 5, 101579.
Yuqing Gu, Chang He, Yuqing Zhang, Li Lin, Benjamin D. Thackray, Jian Ye*. Gap-enhanced Raman tags for physically unclonable anticounterfeiting labels, Nature Communications, 2020, 11, 516.
Yuqing Zhang, Yuqing Gu, Jing He, Benjamin D. Thackray, Jian Ye*. Ultrabright gap-enhanced Raman tags for high-speed bioimaging, Nature Communications, 2019, 10, 3905.
Fugang Liu, Jiaqing Liu, Yang Luo, Siyi Wu, Xu Liu, Haoran Chen, Zhewen Luo, Haitao Yuan, Feng Shen*, Fangfang Zhu*, Jian Ye*. A Single-Cell Metabolic Profiling Characterizes Human Aging via SlipChip-SERS, Advanced Science, 2024, 11(41), 2406668.
Haoran Chen, Ruike Zhao, Xinyuan Bi, Nan Shen, Xi Mo*, Yue Tao*, Zhou Chen*, Jian Ye*. Bacterial identification by metabolite-level interpretable surface-enhanced Raman spectroscopy, Advanced Photonics, 2025, 7(4), 046007.
Yutong Zhou, Yumin Zhang, Haoqiang Xie, Zongyu Wu, Bowen Shi, Linley Li Lin* and Jian Ye*. In Vivo Surface-Enhanced Transmission Raman Spectroscopy and Impact of Frozen Biological Tissues on Lesion Depth Prediction, ACS Nano, 2024, 18, 52, 35393–35404.
Zongyu Wu, Binge Deng, Yutong Zhou, Haoqiang Xie, Yumin Zhang, Li Lin*, and Jian Ye*. Non-Invasive Detection, Precise Localization, and Perioperative Navigation of In Vivo Deep Lesions Using Transmission Raman Spectroscopy, Advanced Science, 2023, 10(24), 2301721.